La Universidad Nacional de Itapúa (UNI) fue creada por Ley Nº 1009, de fecha 3 de diciembre de 1996. Es una institución de derecho público autónoma, con personaría jurídica.
Su proyecto de creación fue presentado el 25 de marzo de 1995 por los miembros de esta Comisión, presidida entonces por el abogado Lorenzo Zacarías López, intendente de la Ciudad de Encarnación, acompañado por distinguidos ciudadanos de bien.
El 26 de noviembre de 1996 el proyecto fue aprobado por la Cámara de Diputados del Congreso Nacional y dos días más tarde, sancionado por la Cámara de Senadores.
El 3 de diciembre, el Poder Ejecutivo promulga Ley 1009 que crea a la UNI. En su comienzo, se regía por la Ley Nº136/93 de Universidades; hoy día, por la Ley Nº 4.995/13 de Educación Superior.
Esta Ley fue entregada en un acto público en Encarnación por el propio Presidente de la República, Ing. Juan Carlos Wasmosy, quien depositó en manos de los miembros de la Comisión Central Coordinadora (CCC), gestores de su creación, el 4 diciembre de 1996.
Organización institucional
El 19 de marzo de 1998, se lleva a cabo la primera Asamblea Universitaria para elegir sus autoridades. Fueron electos Rector, el Abog. Lorenzo Zacarías y Vicerrector, el Ing. Hildegardo González Irala. Así da inicio a la primera etapa de gestión de gobierno, período 1998-2003.
Más adelante, del 2003-2008, fueron electos en la segunda Asamblea Universitaria como Rector, el Ing. Hildegardo González Irala y Vicerrectora, la Dra. Yilda Agüero de Talavera.
Los mismos fueron reelectas para ejercer los periodos de 2008-2013 y 2013-2018.
Para el período 2018-2023 ejercieron como Rector, el Ing. Hildegardo González Irala y como Vicerrectora, la Dra. Nelly Monges de Insfrán, mediante la elección organizada por la Asamblea Universitaria.
Actualmente, el Rector de la Universidad Nacional de Itapúa (UNI), es el Prof. Dr. Hermenegildo Cohene Velázquez y la Vicerrectora, Prof. Dra. Nelly Monges de Insfrán, período 2023-2028.








